Η
πρώτη ταινία των Pokemon είναι σαν μια επέκταση του πρώτου κύκλου
επεισοδίων της σειράς. Η ταινία αναφέρεται στο σπάνιο και μυστηριώδες
Pokemon, τον Mew καθώς επίσης και για τον κλώνο του τον Mewtwo.
O Mewtwo όταν συνειδητοποιεί πως η άνθρωποι που τον δημιούργησαν
τον θέλουν μόνο για να τους υπηρετεί εξοργίζεται και δραπετεύει
από το γυμναστήριο του Giovani, αρχηγού της ομάδας "Πύραυλος".
Πηγαίνει στο νησί στο οποίο υπήρχε το εργαστήριο που τον κλωνοποίησαν.
Εκεί αποφασίζει να ψάξει για τον λόγο της ύπαρξης του και να καταστρέψει
όποιον άνθρωπο η Pokemon μπει στον δρόμο του. Αρκετό καιρό αργότερα
ο Ας αφού έχει κερδίσει μια μάχη Pokemon λαμβάνει μια πρόσκλήση
για ένα αγώνα Pokemon με το μεγαλύτερο εκπαιδευτή Pokemon στον
κόσμο. Λόγο μιας καταιγίδας όμως η γραμμή του πλοίου που θα πήγαινε
αυτόν και άλλους εκπαιδευτές ακυρώνεται. Μερικοί εκπαιδευτές όμως
αψηφούν την καταιγίδα και χρησιμοποιώντας τα Pokemon τους πάνε
στο νησί. Ο Ας μην θέλοντας να μείνει πίσω εμπιστεύεται μια ομάδα
από Βίκινγκς (που δεν είναι άλλοι από την Jessy τον James και
τον Mewth μεταμφιεσμένοι) για να μεταφέρει αυτόν την Misty και
τον Brock στο νησί. Αν και η βάρκα βουλιάζει η ήρωες μα καταφέρνουν
να φτάσουν στο νησί. Εκεί συναντούν τον Mewtwo και 
μαθαίνουν
τα σχέδια του. Οι εκπαιδευτές προκαλούν τον Mewtwo σε μάχη Pokemon
αλλά χάνουν και ο Mewtwo παίρνει τα Pokemon τους ως έπαθλο. Ο
Mewtwo δημιουργεί κλώνους των Pokemon των εκπαιδευτών. Τότε ο
Ας ελευθερώνει τα πρωτότυπα Pokemon και μαζί με αυτά επιτίθεται
στον Mewtwo και τα Pokemon κλώνους τού. Κατά την διάρκεια της
μάχης εμφανίζεται και ο Mew. Ο Mewtwo θέλοντας να αποδείξει την
ανωτερότητα του από τον Mew του επιτίθεται. Ο Mew αρχικά παίζει
σαν μικρό παιδί και αποφεύγει τις επιθέσεις του μην καταλαβαίνοντας
ότι ο Mewtwo θέλει να τον βλάψει αλλά τελικά αναγκάζεται να πολεμήσει.
Ο Ας καταλαβαίνει πως η μάχή που γίνεται δεν βγάζει πουθενά και
το μόνο που κερδίζουν τα Pokemon είναι ο πόνος. Ο Ας μπαίνει ανάμεσα
στις επιθέσεις του Mew και Mewtwo για να τα σταματήσει. Ο Ας χτυπημένος
από την επίθεση πέφτει στο έδαφος και το σώμα του πετρώνει. Τα
Pokemon σταματάνε την μάχη και θρηνούν για τον Ας. Τα δάκρυά τους
το επαναφέρουν στη ζωή και ο Mewtwo καταλαβαίνει το λάθός του.
Ο Mewtwo μαζί με τα υπόλοιπα Pokemon κλώνους φεύγει από το νησί
και πάει να βρει ένα μέρος για να ζήσει ειρηνικά. Μια εκτυφλωτική
λάμψη καλύπτει τα πάντα και οι ήρωες βρίσκονται ξαφνικά στο λιμάνι
όταν είχε αρχίσει η καταιγίδα χωρίς να θυμούνται όλα όσα έγιναν.
